《金陵十三钗》的结局存在不同版本，具体如下：

神父将女学生装在大卡车车厢里顺利逃走

在电影版中，神父约翰·米勒将女学生装在大卡车车厢里，上面盖了好多木板，并用几箱红酒引诱日本人，最终女学生顺利逃走。

玉墨是唯一幸存者

玉墨在电影中毁了自己的容貌并整容，出席了1946年8月在南京举行的对日本战犯的审判大会，指证了日军的罪行。她是唯一幸存者。

其他女子的悲惨命运

其他女子在日军享用后被发送到慰安所，相继逃亡时被击毙、染病、自杀。王熙凤成为了造反派的头目，最终自杀身亡。林黛玉由于久病而去世，宝玉则终日悲痛不已。

有版本中宝玉与黛玉的爱情故事以悲剧收场

在某些版本中，宝玉与黛玉的爱情故事以悲剧收场，黛玉由于久病而去世，宝玉则终日悲痛不已。

有版本中王熙凤成为造反派的头目

在某些版本中，王熙凤成为了造反派的头目，最终自杀身亡。

综上所述，《金陵十三钗》的结局存在多个版本，主要情节包括神父带领女学生逃走、玉墨作为唯一幸存者指证日军罪行以及其他女子悲惨的命运。不同版本之间在细节上有所不同，但总体上都描绘了战争的残酷和人物的悲惨命运。