申请创新基金的基本流程包括以下几个步骤：

注册

企业需要登录科技部技术创新基金网站进行在线注册，填写企业信息，并提交注册资料至当地基层科技主管部门进行审核认证。

申报

注册信息通过审核后，企业可以进入推荐单位网站，选择申报项目栏目进行操作，填写申报材料，并将内容发送至推荐单位。

推荐

推荐单位对企业的申报材料进行审核，并在网上激活，然后对申报项目进行评审，完成本级立项。最后，将已征求财政部门意见并备案的项目的电子申报材料在“技术创新基金网络工作系统”上完成项目推荐工作。

书面材料准备

企业完成全部网上申报后，需要导出企业版申报材料，并按照要求附上相关附件，如近两年审计报告、会计报表、核心资质认证材料、知识产权归属证明文件等，并装订成册。

提交

将装订好的申报材料（包括正式版和所需附件）提交至地方科技情报所或创新基金管理中心进行进一步审核和备案。

后续管理

申请后，企业需要关注评审进度，并在地方项目组织单位评审后，根据国家创新基金的要求进行后续的合同签订、监理和验收等流程。

建议在申请创新基金时，企业应仔细研读当年的创新基金申请须知，了解具体的支持对象、支持方式及申报要求，确保申报材料的真实性和完整性，以提高申请成功率。同时，企业应保持与推荐单位和地方科技主管部门的良好沟通，及时跟进申请进度和反馈信息。