在《蜘蛛侠：至高进化》的大结局中，蜘蛛侠（彼得·帕克）和革命军、虎神等英雄们联手打败了至高进化。在战斗过程中，至高进化似乎还抓住了毒液并利用科技压制了他们融合了。最终，革命军修好了约翰的飞船，帕克表示终于可以回家了。然而，约翰在犹豫，至高化的孙女貌似在祝福他。最终，约翰选择留在了这个星球，而小蜘蛛（彼得·帕克）自己一个人回了地球。最后的结尾是帕克和玛丽在一起说话，然后玛丽转身离开，帕克心里在想着约翰，动漫结束。

需要注意的是，关于至高进化是否死亡，存在不同的说法。有信息称至高进化没死，但造物主死了，这可能意味着至高进化在故事中仍然存活，但造物主的角色已经不存在。这些信息来源的置信度较低，因此在大结局的细节上可能存在不确定性。