PSP6.60系统和6.61系统之间的区别主要在于 6.61系统可以实现固化，而6.60系统需要每次开机运行一下rec。此外，有观点认为6.60系统的刷机流程简单，适合小白用户，而6.61系统虽然提供了免root权限，但可能存在一些插件和PS模拟器的问题，并且可能会导致PSP Go和E1000的游戏中断再开会失效。

综合来看，虽然6.61系统提供了一些额外的功能，但实际使用中两者并没有实质性的区别，用户可以根据自己的需求和设备情况选择合适的系统版本。如果设备是PSP2000-3000v3主板或PSP Go，且希望减少每次关机后再开机的麻烦，可以选择6.61系统。如果设备是PSP1000-2000非v3主板，或者对系统的稳定性和兼容性有较高要求，可以选择继续使用6.60系统。