泰国、缅甸和马来西亚三国在马来半岛的边界划分主要遵循了地理和自然界限的原则。具体来说：

马来半岛北部分界

泰国和缅甸：马来半岛的北部地区被泰国和缅甸分割。东北部属于泰国，西北部属于缅甸。两国的边界线从北到南绵延约1800公里，主要通过山脉和地形来划定。

克拉地峡

泰国和缅甸：克拉地峡是马来半岛上最狭窄的地区，地形相对平坦，海拔较低。泰国和缅甸的边界线在克拉地峡的北部中止，缅甸领土并没有延伸到平坦的克拉地峡。

马来半岛中部分界

泰国和马来西亚：马来半岛的中部地区属于泰国，南部则属于马来西亚。从克拉地峡向南到泰国的北大年府、惹拉府和陶公府之间的地区完全属于泰国，再往南的地区则属于马来西亚。

马来半岛南部

泰国和马来西亚：马来半岛的南部地区完全属于马来西亚。

综上所述，泰国、缅甸和马来西亚三国的边界划分主要依据地理和自然界限，特别是通过山脉和地形来划定。这种划分方式使得各国的领土在马来半岛上呈现出明显的狭长地带，形成了独特的地理特征。