在小说《大秦帝国》中，甘龙的结局是 没有被斩首。秦孝公死后，嬴驷即位，甘龙与杜挚老世族集团与魏国合谋，并策动义渠兵围咸阳，意在另立新君。然而，秦惠文王嬴驷谋定后动，临危不乱，内外左右开弓，快刀斩乱麻，既瘫痪了齐魏联盟，解除了义渠兵祸，又一举铲除了甘龙老世族的复辟阴谋，把老世族们全部缉拿，总共一千多人，全部斩首。

然而，在正史《史记》、《战国策》和《资治通鉴》中，并没有记载甘龙被斩首的结局，应当是正常死亡。

因此，结合小说和正史的信息，可以得出结论：在小说《大秦帝国》中，甘龙虽然被描绘为被斩首的结局，但这并非历史事实。在现实中，甘龙的结局应当是正常死亡。