《名侦探柯南》的主线剧情主要集中在TV版的前几集中，以下是一些关键的主线剧情集数：

新一变小成为柯南

第1集：琴酒给工藤新一灌下药物变小，新一求助阿笠博士，化名江户川柯南住进毛利侦探所。

第2集：变小的工藤新一开始以柯南的身份生活，并首次替小五郎解决案件。

服部平次识破柯南身份

第59-60集：服部平次通过观察和推理，怀疑柯南的身份，最终柯南坦白身份，两人成为好友。

雪莉（宫野志保）出场

第135-141集：雪莉对明美的死耿耿于怀，后被组织关押，她偷服A药逃跑，被阿笠博士收养并化名灰原哀。

黑衣组织的关键事件

第001话：云霄飞车杀人事件，这是黑衣组织首次登场。

第043话：江户川柯南诱拐事件，小五郎知道柯南变小。

第048-049话：外交官杀人事件，平次首次恢复记忆。

第054话：电玩公司杀人事件，再次涉及黑衣组织。

第128话：黑衣组织10亿元抢劫事件。

第129话：来自黑衣组织的女子大学教授杀人事件。

第170-171话：暗阁中的死角，新出登场。

其他重要剧情

第23集：灰原哀透露，半世纪前新一已经在黑衣组织的秘密计划中扮演了重要角色。

这些集数涵盖了《名侦探柯南》中的一些关键主线剧情，包括主角柯南的起源、与黑衣组织的初次交锋、重要角色的登场以及组织内部的秘密。建议观众从这些集数开始观看，以便更好地理解剧情的发展。