医方碑亭里主要有以下碑刻：
《医方集解碑》：
题字为明代医学家李时中所写，碑刻内容为对《伤寒杂病论》的解释和补充，是明代医学史上的重要文献。
《云南池西医药碑》：
题字为清代乾隆帝所写，碑刻内容为对云南医药事业的赞扬和支持，是清代医学史上的重要文献。
《怀素医方碑》：
题字为唐代书法家怀素所写，碑刻内容为对《伤寒杂病论》的注解和评价，是唐代医学史上的重要文献。
《千金宝要》碑：
四通八面，是宋代郭思从孙思邈《千金方》中精选出900多种重要药方汇编而成。
《海上方》碑：
一通两面，传为东海龙王所献，以歌诀的形式写成，载有125方，所列病症都是常见病和多发病。
这些碑刻不仅具有极高的历史和文化价值，也是研究中医学和书法艺术的宝贵资料。
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