抗日战争时期， 军统和中统是国民政府两大特务组织，它们在抗日战争中扮演了不同的角色，并有着明显的职能和结构上的区别。

中统

成立背景：中统是“中国国民党中央执行委员会调查统计局”的简称，成立于1932年，是国民党党内的情报机构，主要负责收集和分析政治、军事、经济等各方面的情报，对维护国民党政权稳定和执行特务活动起到了重要作用。

主要职责：中统的主要任务是监控国民党内部情况，收集内外情报，并对社会舆论及相关思想言论进行监控，同时负责清理党内异己分子，打击一切反对党派。

组织结构：中统设有局长室、人事科、专业室、第一第二组、经济调查处及统计部、调查部等部门，并在全国各省市设有调查部或其他工作部门，工作人员众多，影响力广泛。

军统

成立背景：军统是“国民政府军事委员会调查统计局”的简称，成立于1938年，是军事性质的情报组织，主要服务于国民党军事统帅部，执行反间谍、特务侦查、情报搜集等工作。

主要职责：军统的主要任务是搜集军事情报、反谍以及镇压革命等，包括暗杀、监视、绑架等特务活动。在抗日战争期间，军统在敌后活动和情报工作中扮演了重要角色，组织了多次刺杀和突袭行动，对打击敌人起到了积极作用。

组织结构：军统的组织结构相对严密，层级分明，初期由戴笠负责，后改组为“保密局”和“国防部二厅”。

总结：

军统和中统在抗日战争时期都是服务于国民党政权的情报机关，但它们的职责和侧重点有所不同。中统主要负责党内事务和情报收集，而军统则侧重于军事情报和特务活动。两者在组织结构、职能和历史沿革上都有明显的区别，共同构成了国民党在抗日战争时期的特务体系。