林晓晓背叛何晨光的原因主要是因为 双方之间的误解和缺乏沟通。林晓晓和何晨光因为性格差异、缺乏沟通以及何晨光作为特种兵经常外出执行任务，导致两人之间产生了误会。林晓晓可能误以为何晨光不爱自己，而何晨光可能因为工作忙碌而忽视了林晓晓的感受。此外，林晓晓可能受到了其他人的影响或诱惑，例如王亚东，这也可能导致了她对何晨光的背叛。

具体来说，林晓晓和何晨光的关系因为缺乏沟通而出现了裂痕，林晓晓对何晨光的误会也是基于对事情的不了解所致。何晨光性格骄傲，不服输，而林晓晓作为一个在校女生，思想简单，没有经历过什么事情，这可能导致了她对何晨光的误解和猜疑。此外，何晨光去当兵后，见面与联系的机会减少，这也可能让林晓晓产生了不安全感，进而产生了误会。

在剧情中，林晓晓最终误会何晨光与别的女人有染，从而选择了分手。而何晨光后来与部队里的女教官唐心怡在一起，林晓晓则嫁给了王亚东，但王亚东后来不幸牺牲，留下林晓晓和孩子。

综上所述，林晓晓背叛何晨光的主要原因可以归结为双方之间的误解、缺乏沟通以及林晓晓可能受到的外部影响。