商调函和调档函的区别主要体现在以下几个方面：

发文单位不同

商调函：由有保管档案资格的公司或单位开具，适用于企业之间或企业与人才市场之间的人才调动。

调档函：由人社局下属的人才市场或平级单位开具，适用于人社局下属的人才市场调档案或平级单位调动档案。

档案流动方向不同

商调函：适用于下级单位向上级单位调动档案。

调档函：适用于平级单位之间或向上级单位调动档案。

格式和使用范围不同

商调函：格式较为灵活，适用于企业或人才市场之间的一般调动。

调档函：格式较为正式，通常用于国家事业单位之间或涉及人事档案调阅的情况。

人员身份不同

商调函：通常用于有干部身份的人员调动。

调档函：适用于所有身份的人员调动。

用途不同

商调函：针对个人工作调动，从一个单位申请调动一个人到自己单位工作。

调档函：针对调阅个人档案的情况，需要提供一份材料给档案所在单位。

总结：

商调函和调档函的主要区别在于发文单位、档案流动方向、格式和使用范围、人员身份以及用途。商调函适用于企业或人才市场之间的人才调动，而调档函则适用于人社局下属的人才市场调档案或平级单位调动档案。两者在格式和使用上也有所不同，商调函较为灵活，调档函则较为正式。