南京航空航天大学（Nanjing University of Aeronautics and Astronautics， 简称“南航”） 并未入选985工程，主要基于以下几个原因：

历史选择原因：

985工程启动于1998年，旨在支持一批高校结合国家创新体系进行重点建设。在985工程启动之前和启动初期，南京航空航天大学虽然已经存在并有一定的实力，但并未被选为985工程的重点建设高校。这可能与当时的国家战略和资源配置有关。

地域平衡考虑：

在985工程的评选过程中，国家出于地域平衡的考虑，每个省份通常只有两所985高校的名额。江苏省内，南京航空航天大学和南京大学被选为985高校，这可能与两所学校在江苏省内的地位和综合实力有关。

学科覆盖面和综合性：

985大学在选拔时更注重综合性大学，要求入选高校在学科覆盖面、科研实力、人才培养等方面具有全面优势。虽然南京航空航天大学在航空航天领域具有显著优势，并且有多个学科入选了第二轮“双一流”建设名单，但其整体学科覆盖面和综合性相对较弱，因此未能入选985工程。

评审标准的多样性：

985工程的评审标准包括学科优势、科研实力、人才培养、地理位置、政治因素等多个方面。有些学校虽然实力较强，但由于各种原因（如政治因素、学科布局等）未能入选985工程。

综上所述，南京航空航天大学未能入选985工程主要是由于历史选择、地域平衡、学科覆盖面和综合性以及评审标准的多样性等多种因素的综合影响。尽管如此，南航在航空航天领域具有显著优势，并且有多个学科入选了“双一流”建设名单，其办学水平和综合实力也得到了广泛认可。