透水混凝土表面石子脱落的问题，可以通过以下几个方法进行处理：

减小粗骨料粒径

骨料粒径越小，所形成的结构骨架单位体积内骨料颗粒之间的接触点数量越多，胶结面积就越大，透水混凝土的整体强度比就越高。

增强粘结力

掺入矿物细掺料和高效减水剂，在水泥浆中掺入少量的矿物细掺料，同时使用高效减水剂使其分散，填充于水泥凝胶体的毛细孔和微裂缝中，以达到提高胶结强度的目的。

采用透水混凝土专用有机增强剂改善表层强度，利用其微填充、阻裂和提高粘结力的作用，改善骨料与水泥凝胶体之间界面的性质，从而提高透水性混凝土表层的力学性能。

调整水灰比

水灰比不对可能导致石子脱落，因此需要确保水灰比符合要求，以保证骨料之间的良好粘结。

加强养护

浇筑完成半小时后，必须及时进行养护，应采用薄膜覆盖，养护7天。养护不到位，将会加快骨料中的水份蒸发，影响骨料之间的粘接力，导致石子脱落。

振捣

振捣质量的好坏也是个关键。如果振捣过于密实，则会影响透水率；如果振捣不够密实，则会造成粘接力不够而石子脱落。建议多向熟悉的专业师傅咨询学习。

喷涂保护剂

对于少量脱落，可以采取喷涂保护剂来增加其表面的粘结力度。

重新摊铺

对于大面积脱落，只能重新摊铺透水混凝土。

综上所述，处理透水混凝土表面石子脱落的问题，需要从多个方面入手，包括调整骨料粒径、增强粘结力、调整水灰比、加强养护、确保振捣质量、喷涂保护剂或重新摊铺。具体选择哪种方法，需要根据脱落面积的大小、原因以及实际情况来决定。