《果宝特攻3》更换主角的原因主要有以下几点：

剧组安排：

有观点认为，菠萝吹雪成为主角可能是剧组在安排角色时做出的决定。由于他是穿越而来的角色，并且对古代的事情了解较多，因此自然成为了男主角。

剧情需要：

第三部的背景设定在三国时期，而菠萝吹雪的角色与刘备的形象较为契合，因此他成为了这一部的男主角。此外，橙留香和陆小果作为原有角色，他们的出场率也很高，角色设定并没有太大变化。

角色成长：

在第二部中，菠萝吹雪的角色表现出了强烈的成长和进步，展示了他的潜力和实力。因此，第三部可能会继续围绕菠萝吹雪展开故事，探索他更多的成长和冒险。

观众喜爱：

菠萝吹雪是《果宝特攻》系列中一个非常受欢迎的角色，他具有鲜明的个性，幽默风趣，同时在战斗中也展现出强大的实力，深受观众喜爱。因此，从观众的角度来看，菠萝吹雪成为主角也是合情合理的。

综上所述，菠萝吹雪成为《果宝特攻3》的主角，主要是基于剧组安排、剧情需要、角色成长以及观众喜爱等多方面的考虑。