在自动化考研方面，东南大学、华东理工大学和南京理工大学各有其优势。以下是三者的对比：

实力对比

东南大学：东南大学的工科实力在中国大学中大概排在5-8名之间，与同济大学一个档次，整体实力较强。

华东理工大学：华东理工大学的实力与南京理工大学差不多，但不考虑上海地域因素，甚至可能略逊于南京理工大学。

南京理工大学：南京理工大学的控制专业在教育部第四次学科水平评估中排名进入前20%（B+类），在211高校中算是佼佼者，自动化专业也是其强势专业。

专业排名

东南大学：自动化专业全国排名大概在第6名左右，是三校中最好的。

华东理工大学：自动化专业全国排名相对较后，但具体排名未详细列出。

南京理工大学：自动化专业排名也很靠前，但具体排名未详细列出。

就业情况

东南大学：东南大学的自动化专业就业情况最好，毕业生路径宽，就业前景好。

华东理工大学：华东理工大学在化工专业方面较强，自动化专业的就业情况也不错，但整体就业情况略逊于东南大学。

南京理工大学：南京理工大学的自动化专业毕业生有研究所、事业单位、科研机构、通讯行业、互联网大厂等众多职位选择，就业情况较好，尤其在南方就业市场有竞争力。

报考热度

东南大学：报考热度较高，竞争激烈。

华东理工大学：报考热度相对较低。

南京理工大学：报考热度较高，尤其是江苏省的学生，报录比超过一般的211高校。

建议

东南大学：如果考生对自动化专业有较高要求，且希望进入一所综合实力强、就业前景好的学校，东南大学是理想的选择。

华东理工大学：如果考生对化工专业有浓厚兴趣，或者希望在华东地区有较好的就业前景，华东理工大学也是一个不错的选择。

南京理工大学：如果考生希望在控制科学和自动化领域有深入发展，且不介意报考热度较高的情况，南京理工大学是一个值得考虑的学校。

考生可以根据自身兴趣、专业要求和就业期望，综合考虑这三所学校的优劣，选择最适合自己的学校。