回复征求意见稿的修改意见时，可以遵循以下步骤和格式：

开头感谢

首先，表达对征求意见稿修改意见的感谢。例如：“非常感谢您对我们征求意见稿的修改意见，我们非常重视您的建议。”

具体回应

针对每一条修改意见进行具体回应。例如：“关于您提出的第一条修改意见，我们已经认真考虑，并对征求意见稿进行了相应的修改。”

解释修改原因和目的

解释为什么要进行这些修改，以及修改的目的。例如：“我们修改征求意见稿的目的是为了更好地满足用户需求，并提供更优质的产品或服务。”

提供进一步讨论的机会

如果有任何疑问或需要进一步讨论，可以表示愿意继续沟通。例如：“如果您对我们的修改还有任何疑问或建议，请随时与我们联系。我们非常乐意与您进一步讨论。”

再次感谢

最后，再次感谢对方提出的宝贵意见。例如：“再次感谢您的宝贵建议。您的意见对我们非常重要，帮助我们不断优化和改进。”

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尊敬的[相关部门或人员]：

感谢您对我们征求意见稿的修改意见，我们非常重视您的建议。

关于您提出的第一条修改意见，我们已经认真考虑，并对征求意见稿进行了相应的修改。我们修改征求意见稿的目的是为了更好地满足用户需求，并提供更优质的产品或服务。

如果您对我们的修改还有任何疑问或建议，请随时与我们联系。我们非常乐意与您进一步讨论。

再次感谢您的宝贵建议。您的意见对我们非常重要，帮助我们不断优化和改进。

此致

敬礼!

[您的姓名或部门名称]

[日期]

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通过以上步骤和格式，可以确保您的回复既专业又具有礼貌，充分展示对反馈的重视和尊重。