水环式真空泵的效率高于射水抽气器。具体来说，水环式真空泵的效率一般在30%左右，较好的可达50%，而射水抽气器的效率则较低。此外，水环式真空泵在运行中更具有安全可靠性，而且比较经济，运行维护费用较低，所消耗的厂用电比射水抽气器节省一半左右。

尽管水环式真空泵的初始投资较高，但由于其高效率和低运行成本，综合效益更好。特别是在需要高真空度和稳定运行的场合，水环式真空泵的表现更为出色。例如，在300MW以上的大机组中，水环式真空泵已经取代了射水抽气器。

因此，从效率和运行成本的角度考虑，水环式真空泵是更优的选择。