《金陵十三钗》的结局存在多个版本，但主要情节相似，以下是较为常见和认可的结局：

玉墨的幸存与揭露真相

玉墨是唯一一个幸存下来的女子，她毁了自己的容貌并整容，以出席1946年8月的南京审判会，揭露日军的罪行。

其他女子的悲惨命运

除了玉墨外，其他女子都遭到了不幸的结局。有些女子在日军享用后被发送到慰安所，相继逃亡时被击毙、染病或自杀。

神父的牺牲

神父约翰·米勒将女学生装在大卡车车厢里，上面盖了木板和红酒，用来引诱日本人，最终女学生顺利逃走。

傅红雪的自杀

在某些版本中，主人公傅红雪最终被逼自杀。

其他角色的死亡

王熙凤成为造反派的头目，最终自杀身亡；晴雯加入义和团，在战乱中牺牲；黛玉由于久病而去世，宝玉则终日悲痛不已。

综合来看，玉墨的幸存和揭露日军罪行的情节是较为一致的部分，而其他女子的命运和具体细节则因版本不同而有所差异。