在《海底两万里》中，尼摩船长和他的船员们经历了以下危险：

搁浅和土著人围攻：

在巴布亚新几内亚，他们的船搁浅了，并遭到了土著人的围攻。尼摩船长用他的闪电挡住土著人进入“鹦鹉螺”号。

鲨鱼攻击：

在海底养珠场时，他们受到了鲨鱼的攻击。捕鲸手尼德·兰手刃了一条凶恶的巨鲨。

被困在冰川之下：

行驶到南极时，船被困在了冰川之下，船上的人轮流破冰最终脱困。

巨型章鱼袭击：

前往北极的途中，他们遇到了巨型章鱼的袭击。

英国驱逐舰的攻击：

在北大西洋，他们受到英国驱逐舰的攻击，最终用“鹦鹉螺”号把驱逐舰击沉。

这些危险情况不仅考验着船员的勇气和智慧，也增加了故事的紧张和冒险氛围。