甲方指定的材料价格高于市场价格是否合法， 取决于具体情况。以下是一些关键点：

合同约定

如果合同中明确规定了材料价格高于市场价格，并且双方同意，那么这种行为可能是合法的。

如果合同中没有明确规定，但甲方单方面指定了高于市场价格的材料，这可能被视为显失公平，乙方可以要求变更或撤销该条款。

市场情况

如果甲方指定的材料价格高于市场价，且没有合理的解释（如品牌、规格、产地等因素不同），则可能不合法。

如果价格高出市场水平，但符合《中华人民共和国价格法规》第十四条的规定，且没有故意制造物价上涨或虚假价格策略，则未必涉及违规。

法律规定

根据《价格违法行为行政处罚规定》第七条，如果商家利用虚假或误导性价格手段诱导消费者，可能会被认定为违法行为。

如果价格上涨幅度超过特定比例（如30%），公众有权向政府价格监管部门提出举报与投诉。

公平原则

如果甲方指定的材料价格明显高于市场价格，且没有合理的商业理由，这可能被视为不公平交易行为，乙方可以主张合同无效或要求变更。

综上所述，甲方指定的材料价格高于市场价格是否合法，需要结合合同约定、市场情况、法律规定以及公平原则等因素进行综合判断。如果存在争议，建议通过协商、调解或法律途径解决。