是的，孟祈佑和连思之间确实存在孩子，而这一切都是马馥雅的设计。以下是详细情况：

设计怀孕：

马馥雅为了救出被囚禁的孟祈佑，故意让孟祈佑喝下药水失去意识，然后安排刘连思与昏迷中的孟祈佑共处一室，从而使得刘连思有机会与孟祈佑发生关系并最终怀孕。

保护孟祈佑：

连思的孩子是在孟祈佑沦为北汉阶下囚的时候威胁到了马馥雅，马馥雅为了保护孟祈佑，让刘连思假装成馥雅与他同床，从而了了连思的愿。

情感纠葛：

尽管连思和孟祈佑之间存在孩子，但孟祈佑对连思的感情并不深厚。他可能只是出于责任关系，或者是因为孩子而于心不忍，但并没有真正的爱情。

综上所述，孟祈佑和连思的孩子是马馥雅为了救出孟祈佑而设计的结果，孟祈佑对连思并没有真正的爱情，但他出于责任和孩子的原因，没有抛弃连思。