对于C盘的文件系统类型选择， NTFS是目前主流且推荐的选择。以下是选择NTFS文件系统的原因：

安全性高：

NTFS提供了更好的文件系统安全特性，包括文件权限设置和加密功能，可以更有效地保护数据安全。

支持大文件：

NTFS支持单个文件超过4GB，而FAT32格式不支持。

减少磁盘碎片：

NTFS通过簇的管理方式，可以有效减少磁盘碎片，提高文件读写性能。

更好的兼容性：

虽然Windows 9x/Me和DOS系统不能直接访问NTFS分区，但可以通过第三方软件实现访问，且Windows NT/2000/XP等系统对NTFS有良好支持。

管理方便：

NTFS提供了更多的磁盘管理功能，如磁盘配额、文件级压缩等，便于系统管理员进行磁盘管理。

综上所述，如果你使用的是Windows NT/2000/XP等系统，建议将C盘格式化为NTFS文件系统，以获得更好的性能、安全性和管理便利性。如果你需要与其他操作系统（如Linux或DOS）进行多重引导，则C盘可以选择FAT32格式。