在钱钟书的小说《围城》中，方鸿渐被三闾大学辞退的原因是多方面的，主要包括以下几点：

学历问题：

方鸿渐虽然被高松年校长以教授的名义邀请，但实际上并没有学位，仅仅是个游学生。高松年在发现这一点后，认为方鸿渐的职位不应该是教授，而只能是副教授。

个性特质：

方鸿渐个性中的不拘小节和直率导致他与同事之间的关系处理得并不好。他与韩学愈、顾尔谦、陆子潇等同事之间的矛盾，以及他与孙柔嘉的婚姻问题，都使得他在三闾大学的日子越来越难以维系。

人际交往能力：

方鸿渐在处理事务上缺乏圆滑的技巧，这在他与高松年、李梅亭、范懿等校方人物的交往中体现出来。他的直言不讳和缺乏政治敏感性使得他在三闾大学的职业生涯中不断遇到困难。

社会政治环境：

《围城》所反映的是抗战时期的中国，大学的运行也受到了战争和政治的影响，这对方鸿渐这样的知识分子来说，无疑增加了生存和发展的难度。

被揭发思想问题：

方鸿渐因陆子潇告密，被揭发其思想不纯，具体是因为他的一本《家庭大学丛书》被陆子潇发现，而这本书是赵辛楣丢下来的，封面印有communism，这使得方鸿渐被人揭发其思想不纯，最终被高松年辞退。

综上所述，方鸿渐被三闾大学辞退是多方面因素共同作用的结果，包括他的学历问题、个性特质、人际交往能力以及所处的社会政治环境等。