北京清河站和北京南站之间确实存在联络线。根据最新的信息，这条联络线已经建成并投入使用。联络线的北端衔接京张高速铁路，南端则通过广安门站衔接京雄城际铁路、北京丰台站和北京南站。这条联络线的建设，有效实现了北京枢纽内京张高速铁路与京广、京沪、京港台高速铁路，以及京雄城际铁路、京津城际铁路等南向高速铁路的便捷联通，提升了枢纽内的互联互通水平。

乘客可以通过乘坐地铁13号线至西直门站，然后换乘地铁4号线大兴线，直接到达北京南站。整个行程大约需要1小时左右的时间。此外，也可以选择乘坐市郊铁路怀密线S512线，换乘地铁4号线大兴线，全程约为23公里，需要大约1小时。

这些信息表明，无论是通过地铁还是市郊铁路，从清河站到北京南站都有便捷的交通工具可供选择。建议根据个人需求和实际情况选择最合适的出行方式。