商调函和调档函的区别主要体现在以下几个方面：

发文单位不同

商调函：通常由有保管档案资格的公司或单位开具，用于国有单位之间的人才流动。

调档函：由人社局下属的人才市场或其他单位开具，用于调阅个人人事档案。

人员身份不同

商调函：适用于有干部身份的人员调动。

调档函：适用于没有干部身份的人员调动。

档案流动方向不同

商调函：适用于下级单位向上级单位调动档案。

调档函：适用于平级单位或人社局下属的人才市场调动档案。

格式不同

商调函：格式较为灵活，适用于企业或人才市场之间的一般调动。

调档函：格式较为统一，通常用于国家事业单位之间的调动。

制度背景不同

商调函：适用于高度计划体制下的人事管理制度，是国有单位之间人才流动的一种手续。

调档函：也是人事工作术语，产生于高度计划体制下，用于调入单位向拟调入人当前所在单位发出的调阅个人人事档案的函件。

总结：

商调函和调档函的主要区别在于发文单位、人员身份、档案流动方向、格式和制度背景。商调函适用于国有单位之间的人才流动，而调档函则是人事管理制度下的调动手续之一，适用于单位内部人事档案的调阅。了解这些区别有助于正确选择和使用这两种函件，确保人事调动的顺利进行。