东汉末年的行政区划主要包括以下郡及主要县：

司州

河东郡：治所在安邑（今山西夏县），主要县有河东、平陆、闻喜等。

河内郡：治所在怀县（今河南武陟西南），主要县有河内、野王、沁水等。

河南郡：治所在雒阳（今河南洛阳东北），主要县有洛阳、河南、偃师等。

弘农郡：治所在弘农（今河南灵宝北黄河南岸），主要县有弘农、陕县、湖县等。

京兆尹：治所在长安（今陕西西安），主要县有长安、长陵、阳唆等。

冯翎郡：治所在高陵（今陕西高陵），主要县有高陵、池阳、夏阳等。

扶风郡：治所在槐里（今陕西兴平），主要县有槐里、美阳、武功等。

青州

平原郡：治所在平原（今山东平原），主要县有平原、高唐、临菑等。

东莱郡：治所在掖县（今山东莱州），主要县有掖县、胶西、即墨等。

济南国：治所在临淄（今山东淄博），主要县有临淄、营陵、平度等。

乐安国：治所在临淄（今山东惠民），主要县有临淄、乐安、博兴等。

北海国：治所在剧县（今山东昌乐），主要县有剧县、营陵、平度等。

齐国：治所在临淄（今山东淄博），主要县有临淄、营陵、平度等。

徐州

东莞郡：治所在莒县（今山东莒县），主要县有莒县、东莞、姑幕等。

琅琊国：治所在开阳（今山东临沂），主要县有开阳、临沂、营县等。

彭城国：治所在彭城（今江苏徐州），主要县有彭城、武原、下邳等。

东海国：治所在郯县（今山东郯城），主要县有郯县、东海、下邳等。

下邳郡：治所在下邳（今江苏睢宁），主要县有下邳、良城、睢宁等。

广陵郡：治所在广陵（今江苏扬州），主要县有广陵、江都、高邮等。

兖州

陈留郡：治所在陈留（今河南开封），主要县有陈留、尉氏、开封等。

济阴郡：治所在济阴（今山东定陶），主要县有济阴、冤句、乘氏等。

山阳郡：治所在昌邑（今山东金乡县），主要县有昌邑、巨野、金乡等。

任城郡：治所在任城（今山东济宁），主要县有任城、亢父、桃林等。

东平国：治所在无盐（今山东东平），主要县有无盐、东平、任城等。

东郡：治所在濮阳（今河南濮阳），主要县有濮阳、范县、观城等。

泰山郡：治所在博县（今山东泰安），主要县有博县、奉高、嬴县等。

济北国：治所在卢县（今山东济南），主要县有卢县、茌平、肥城等。

豫州

陈郡：治所在陈县（今河南淮阳），主要县有陈县、苦县、阳夏等。

汝南郡：治所在平舆（今河南汝南），主要县有平舆、汝南、上蔡等。

安丰郡：治所在安丰（今安徽寿县），主要县有安丰、下蔡、霍丘等。

弋阳郡：治所在弋阳（今河南光山），主要县有弋阳、西平、光山等。

颍川郡：治所在许昌（今