小花仙第二部《小花仙之精灵王传奇》和第三部《小花仙3》之间存在一些间隔，具体原因如下：

剧场版：

在第二季和第三季之间，有一个剧场版。这个剧场版可能是导致两部动画之间有时间间隔的原因之一。

跳票：

有消息称，小花仙第三季原定于2017年1月20日上映，但后来有跳票的情况发生，导致具体播放时间以网络首播为主。

综合以上信息，可以推测小花仙第二部和第三部之间之所以有时间间隔，是因为中间隔了一个剧场版，并且可能还涉及到跳票的情况。