事业单位工作人员年度考核表的一式几份，存在以下几种情况：

一式两份

个人填写完成后，需要打印一式两份。

上级主管部门审核后，一份进入个人档案，另一份返回单位存档。

一式四份

事业单位填写一式四份，分别交给事业单位、主管部门、政府人社部门、工资审核部门各一份。

一式三份

机关事业单位年度考核表一式三份，一份自己保留单位作为个人档案，一份留给人社局留底，还有一份交给档案室存档入个人档案里。

综合以上信息，可以得出以下结论：

通常情况：事业单位工作人员年度考核表一般是一式两份，一份进入个人档案，另一份返回单位存档。

特殊情况：在某些情况下，也可能是一式四份，分别交给不同的部门存档。

建议在实际填写时，以单位要求为准，确保考核表的存档和使用符合相关规定。