三方协议中的院系审核意见主要是表明院系是否同意毕业生与用人单位达成的就业协议。在校园招聘现场，如果本校毕业生与用人单位达成了就业协议，作为院系的代表需要当场参加，对毕业生和用人单位进行监督，审核他们达成协议是否合法合规，学生的权利是否得到良好的保障。如果同意，院系也要在三方协议上签字盖章。

撰写三方协议院系意见时，可以参考以下要点：

思想政治表现：

评价学生在政治立场、组织观念、理论学习、政策贯彻等方面的表现。

学习情况：

评价学生的学习态度、成绩、专业知识和学习能力。

社会实践与活动参与：

评价学生在校期间参与社会实践和活动的表现，如团队精神和集体荣誉感等。

综合能力：

评价学生的综合能力，如领导能力、沟通能力、协作精神等。

需要注意的是，三方协议的院系审核意见需要院系负责人签字并盖章，以确保其法律效力。