选择Windows Server 2008的最佳版本取决于您的具体需求。以下是针对不同规模企业的版本特点：

Windows Server 2008 Standard Edition （标准版）

特点：面向中小企业，支持Windows Server 2008功能中最长部署的版本。

内存和CPU支持

32位版本最多支持4GB内存，在SMP配置下最多支持4个CPU。

64位版本最多支持32GB内存，在SMP配置下最多支持4个CPU。

网络功能：支持网络负载平衡集群，但不支持故障转移集群。

Windows Server 2008 Enterprise Edition （企业版）

特点：针对大型企业，提供高级功能如故障转移集群和AD联合身份验证。

内存和CPU支持

32位版本最多支持64GB内存，在SMP配置下最多支持8个CPU。

64位版本最多支持2TB内存，在SMP配置下最多支持8个CPU。

Windows Server 2008 Datacenter Edition （数据中心版）

特点：针对超大规模的企业，提供最高级别的性能和功能。

内存和CPU支持

32位版本最多支持64GB内存，在SMP配置下最多支持32个CPU。

64位版本最多支持2TB内存，在SMP配置下最多支持64个CPU。

Windows Web Server 2008 （Web应用程序服务器）

特点：

专为Web应用程序设计。

功能：支持IIS 7.0，提供强大的Web服务功能。

建议

中小企业：如果您的企业规模较小，且主要需求是基本的Web服务和文件共享，Windows Server 2008 Standard Edition是一个经济实惠的选择。

大型企业：对于需要高级功能如故障转移集群、高内存和CPU支持的企业，Windows Server 2008 Enterprise Edition或Datacenter Edition是更好的选择。

Web应用程序：如果您计划部署Web应用程序，Windows Web Server 2008提供了专为Web服务器优化的功能。

根据您的具体需求和预算，选择最适合您的版本可以确保服务器的高效运行和长期稳定性。