在历史上，建宁公主与吴应熊的婚姻是清朝政府为了笼络吴三桂而安排的。两人婚后感情生活和谐，并育有多个子女。吴应熊在婚后被封为和硕额驸，并加封少保兼太子太保衔，看似风光无限，但实际上他成为了清廷挟制吴三桂的一枚重要棋子。

然而，随着吴三桂的不满和反抗，三藩之乱爆发，吴应熊被康熙皇帝处以绞刑，建宁公主失去了丈夫和儿子。在吴三桂叛乱被平定后，吴氏家族的影响力逐渐消失，建宁公主也在无尽的寂寞和痛苦中度过了余生，直至1703年去世，享年63岁。

因此，建宁公主和吴应熊的大结局是悲惨的，建宁公主孤独地走完了一生。