在电视剧《一起来看流星雨》中，端木磊和于馨的感情线主要集中在该剧的第二部。以下是他们感情发展的关键集数：

第二十五集后半部分：

于馨给端木表白之后，端木开始接受于馨。

第三十集左右：

端木生病，由于馨来照顾，最终端木向于馨表白，两人在一起。

第三十三集快完的时候：

端木在生日会上突然倒下，之后在医院抱住于馨，表示在她生命的最后日子里，他会把她当作最重要的人去守护。

因此，端木磊和于馨在电视剧《一起来看流星雨》的第二部中，大约在第三十集左右开始在一起。