马苏和孔令辉的分手原因主要有以下几点：

聚少离多：

马苏在综艺节目中透露，两人因为工作繁忙，一年在一起的时间加起来不超过两个月，这使得他们之间的关系变得越来越淡薄。

价值观和生活理念的差异：

马苏希望能在自己的领域继续前行，追求自我实现，而孔令辉则希望马苏能全身心地投入到家庭生活中，承担起作为妻子的责任。这种现代女性的价值追求与孔令辉的传统观念，成为了两人关系中最终无法调和的裂痕。

性格和生活方式的矛盾：

马苏是一个外向的人，喜欢玩、表演和营造人设，而孔令辉则是一个内向型传统式且具备大男人主义的人。这种性格和生活方式的差异，使得他们在生活中容易产生矛盾。

事业的压力：

两人都面临着巨大的事业压力，孔令辉因酒驾、D博等丑闻职业生涯彻底结束，而马苏也因为某些言论陷入了舆论漩涡，事业受到了很大影响。

争吵和反思：

最终，一场激烈的争吵引发了感情的反思，马苏意识到再也无法容忍一味的牺牲与不平，决定放手结束这段长达11年的爱情故事。

综上所述，马苏和孔令辉的分手是多种因素共同作用的结果，包括聚少离多、价值观和生活理念的差异、性格和生活方式的矛盾、事业的压力以及争吵和反思。