武则天杀上官婉儿的原因并没有一个确凿的历史记载，但根据一些史料和传说，可以推测出几种可能的原因：

权力斗争：

上官婉儿在武则天时期是她的心腹，但她在政治斗争中可能触犯了武则天，或者被其他权贵所利用，导致武则天对她产生不满或猜忌。

个人恩怨：

有传说称上官婉儿与武则天的男宠张昌宗有染，被武则天发现后，武则天愤怒之下想要杀她，但最终因为张昌宗的求情而饶他一命，但她在额头上被刺了“忤旨”二字作为惩罚。

政治失误：

上官婉儿在武则天退位后，依然在宫中保持着重要的地位，但在唐中宗时期，她与太平公主共同起草遗诏，试图维护自身的利益，这一计划被李隆基识破并发动政变，最终导致她被杀。

家族背景：

上官婉儿的祖父上官仪曾经主张废除武则天的诏书，被武则天杀害，上官婉儿的母亲也沦为婢女。上官婉儿作为上官仪的后人，可能在某种程度上被视为武则天的敌人或威胁。

综合以上几点，可以推测武则天杀上官婉儿的原因可能与权力斗争、个人恩怨、政治失误以及家族背景等多方面因素有关。然而，由于历史记载有限，这些原因都只能作为参考，不能确定其真实性。