在新白发魔女传中，耿绍南和何萼华的情感纠葛是一大看点。耿绍南表面上是武当派大弟子，实际上却隐藏着皇子身份，他的命运因政变而充满波折。他深爱着何萼华，但因为何萼华对卓一航的感情越来越深，耿绍南由爱生恨，最终与师兄弟反目成仇，走上不归路。

在剧中，耿绍南受伤后，被卓一航吩咐何萼华和辛龙子带回客栈，而卓一航则去引开敌人。两人被困山洞时，卓一航试图用武当的两仪剑法抵挡敌人，但最终未能成功逃脱。在这一过程中，何萼华对耿绍南的感情也经历了考验，但她对卓一航的感情始终如一，最终未能回应耿绍南的爱。

在大结局中，耿绍南决定与一切恩怨了结，何萼华在耿绍南离开之前向他表达了心意。然而，卓一航和练霓裳之间的情感纠葛也达到了高潮，卓一航最终选择牺牲自己来拯救练霓裳。在一系列激战后，耿绍南与卓一航展开了宿命对决，最终耿绍南被卓一航手刃，为武当清理了门户。何萼华则前往天山赴约，与卓一航告别。

综上所述，耿绍南和何萼华的爱情最终没有走到一起，耿绍南因爱生恨，最终走向了悲剧的结局。