小智的神奇宝贝在以下集数中进行了进化：

AG66：

小智的木守宫进化成森林蜥蜴。

AG80：

未提及具体进化。

AG123：

未提及具体进化。

AF154：

未提及具体进化。

AG161：

小智的森林蜥蜴进化成蜥蜴王。

此外，其他一些集数中也有小智的神奇宝贝进行进化，例如：

精选 第22集：小智的豆豆鸽进化成波波鸽。

精选 第23集：小智的虫宝包进化成宝包茧。

精选 第61集：小智的石丸子进化成地幔岩。

精选 第68集：小智的波波鸽进化成轰隆雉鸡。

精选 第74集：小智的宝包茧进化成保母虫。

精选 第77集：小智的暖暖猪进化成炒炒猪。

精选 第92集：小智的混混鳄进化成流氓鳄。

建议查阅具体的集数内容以获取更详细的信息。