《神厨小福贵》中小飞蝶的命运是 在剧情的较早阶段就结束了。在 第117集中，小飞蝶在老佛爷面前为小福贵顶罪，但小李子不忍心让她送命，于是制造了六月飞雪的假象。老佛爷在刑场上看到小飞蝶的玉佩后，意识到她就是自己寻找的小格格，于是决定次日为她举行册封仪式，从而救了小飞蝶一命。

然而，尽管小飞蝶免于死刑，但小福贵的金手指被毁，并且失去了嗅觉和味觉，这对他的厨艺造成了巨大的打击。在剧情的最后，小福贵在经历了种种磨难后，领悟到了民间才有真情，似乎听到了小飞蝶的呼唤，最终决定离开皇宫，去寻找属于自己的生活。

因此，小飞蝶并没有在剧情的后期死亡，而是在较早的第117集中被救了，并在后续的剧情中以另一种形式继续存在。