在深圳南山区，您可以在以下几个地点办理港澳通行证：

南山分局出入境服务大厅

地址：深圳市南山区南山大道3018号。

营业时间：周一至周五，上午9:00—12:00，下午14:00—18:00。

区委服务大厅

地址：南山区桃园路2号。

南山所前海E站通服务大厅

地址：南山区前湾一路19号。

南山所南园警务室

地址：南山区南新路南园村新六坊3号（24小时）。

南山所向南警务室

地址：南山区向南东村商业街61号（24小时）。

沙河所户政室

地址：南山区石洲北路12号（24小时）。

粤海所户政室

地址：南山区学府路95号蛇。

蛇口所户政室

地址：南山区蛇口花果路68号。

招商所户政室

地址：南山区公园路23号（24小时）。

南山公安分局出入境管理大队

地址：深圳市南山区深南大道388号深南大道与南山大道交汇处。

建议您根据最新权威信息选择合适的地点和时间办理港澳通行证，以确保流程顺利。