《金陵十三钗》的结局存在不同版本，具体如下：

神父将女学生装在大卡车车厢里顺利逃走

在电影《金陵十三钗》中，神父约翰·米勒将女学生装在大卡车车厢里，上面盖了好多木板，并用几箱红酒引诱日本人，最终女学生顺利逃走。

唯一幸存的赵玉墨在1946年南京审判会上指证日军强奸，书娟从嗓音辨认出她，但她已被毁容。

其他女子悲惨的结局

除了赵玉墨外，其他12个女子在日军享用后被发送到慰安所，相继逃亡时被击毙、染病、自杀。

王熙凤成为造反派的头目，最终自杀身亡。

晴雯加入了义和团，在战乱中牺牲。

林黛玉由于久病而去世，宝玉则终日悲痛不已。

小说中的结局

在严歌苓的同名小说中，玉墨是唯一幸存者，她毁了自己的容貌并整容，出席了审判，揭露了南京大屠杀的真相。

小说中其他女子的结局也较为悲惨，但具体细节与电影有所不同。

综上所述，《金陵十三钗》的结局中，神父成功救出女学生，但赵玉墨是唯一幸存的女子，她在审判会上揭露了日军的罪行。其他女子则遭遇了不同的悲惨命运。