《火影忍者》的结局中，主要角色的命运如下：

漩涡鸣人：

成为第七代火影，和雏田结婚，并有一儿一女。

宇智波佐助：

环游世界，和小樱结婚，两人有一个女儿。

旗木卡卡西：

退位后与迈特·凯结伴出去玩了。

奈良鹿丸：

成为鸣人的军师，和手鞠结婚，有一儿子。

秋道丁次：

娶了云隐村的一位黑皮妹子，有一女儿。

山中井野：

嫁给了佐井，有一儿子。

油女志乃：

成为学校的老师。

天天：

成为武器店的老板。

李洛克：

带着儿子继续青春。

自来也：

死于与佩恩的战斗，尸体被沉入深海。

宇智波鼬：

牺牲自己，帮助鸣人和佐助封印大筒木辉夜，未能与家人团聚。

日向宁次：

在保护鸣人的战斗中牺牲。

此外，还有一些角色在剧情中或结尾处有提及但未详细描述其最终命运，例如：

春野樱：在佐助离开木叶后，她成为了木叶村的重要医疗忍者。

旗木凯：与卡卡西一同退位后去旅行。

宇智波带土：在封印大筒木辉夜的战斗中牺牲。

药师兜：在剧情中扮演重要角色，但具体结局未明确提及。

总体来说，《火影忍者》的结局是一个大团圆，大部分主要角色都找到了属于自己的幸福，尽管有些角色的命运充满了悲剧色彩。