年底双薪的个人所得税计算方式主要有以下几种：

合并计税

将年底双薪与年终奖一起计算，作为全年的综合所得来计算个税。

具体操作是将年底双薪与年终奖合并后除以12个月，然后根据这个平均数来确定适用的税率和速算扣除数。

这种方法通常适用于年终奖较大或者希望通过合并减少税负的情况。

单独计税

将年底双薪单独作为一个月的工资来计算个税。

在这种情况下，年底双薪通常被视为第13个月的工资，与其他月份的工资一起计算个税。

具体到税率和速算扣除数的选择，需要根据国家最新的个人所得税法规定来确定。

计算公式

应纳税所得额 = 月度收入 - 起征点 - 专项扣除（五险一金等） - 专项附加扣除 - 依法确定的其他扣除。

起征点为5000元的情况下，没有专项附加扣除，每月需缴纳（10000-5000-2000）×3%=90元个税。

建议

了解最新税法：由于税法可能会有变动，建议在计算个税前，查阅最新的个人所得税法规定，以确保计算的准确性。

咨询专业人士：如果对个税计算有疑问，可以咨询专业的税务顾问或财务人员，以获得更准确的指导。

保存相关凭证：在计算个税时，保存好所有相关的收入证明和扣除凭证，以便在需要时提供。