柯南剧场版的顺序如下：

1. 《时计巨人的侵略》

2. 《四个名侦探》

3. 《绝海的侦探》

4. 《瞳孔中的暗杀者》

5. 《贝克街的亡灵》

6. 《迷宫的十字路口》

7. 《引爆摩天楼》

8. 《第十四个目标》

9. 《世纪末的魔术师》

10. 《通往天国的倒计时》

11. 《银翼的魔术师》

12. 《水平线上的阴谋》

13. 《侦探们的镇魂歌》

14. 《绀碧之棺》

15. 《战栗的乐谱》

16. 《漆黑的追踪者》

17. 《天空的遇难船》

18. 《沉默的15分钟》

19. 《第11位前锋》

20. 《异次元的狙击手》

21. 《业火的向日葵》

22. 《纯黑的噩梦》

23. 《唐红的恋歌》

24. 《零的执行人》

25. 《绀青之拳》

26. 《独眼的残像》

建议按照批评分从高到低的顺序观看，或者按照漫画时间线顺序以及当时的人物关系来观看。