女娲补天的神话故事最早记载于 《淮南子》中。《淮南子》是西汉皇族淮南王刘安及其门客集体编写的一部哲学著作，属于杂家作品。该书在继承先秦道家思想的基础上，综合了诸子百家学说中的精华部分，对后世研究秦汉时期文化起到了不可替代的作用。

故事讲述了在远古时期，水神共工与火神祝融因争夺权力而发生战争。共工战败，一头撞上了不周山，导致天塌了一个大洞，大地上洪水泛滥，到处是熊熊的大火，六种怪兽不知道从什么地方钻了出来，残害着人类。善良的女娲神看见她的子民们在洪水和大火中四处逃生，心里十分难过，只好辛辛苦苦地去修补破损的天空。

因此，女娲补天的神话故事最早记载于《淮南子》中，并且也在其他古籍如《山海经》中有所提及。