东莞市跨省转学籍取消教育局盖章的原因主要是 电子学籍系统的普及。现在转学都是电子学籍，取消纸质环节，可以提高效率，也更环保。此外，根据2014年教育部的规定，转学证明不需要教育局盖章，只需要转入学校在转学证明上盖章就可以了。

具体来说，中小学生学籍信息管理系统在学校和区县学籍管理员处理环节的基础上设置了学校和区县教育行政部门负责人的核办环节，相当于纸质材料的盖章审批。办理转学手续需要提供5份有关材料，分别为《中小学生转学申请登记表》；学生学籍基础信息表（由转出学校从全国学籍系统打印并盖章确认）；《居民户口簿》、实际常住地居住证明的原件和复印件（经核查后留复印件）。

因此，现在东莞市跨省转学籍只需要转入学校在转学证明上盖章，不再需要教育局盖章。这一变化旨在简化转学手续，提高办理效率，并减少纸质材料的浪费。