小娘惹玉秀的结局是悲剧。在剧情中，宋怀恩的野心逐渐膨胀，玉秀试图劝阻他，但最终被宋怀恩圈禁。后来，虽然被王儇救出，但王儇为了镇压宋怀恩的叛乱，将玉秀和她的两个孩子软禁，并试图利用他们来威胁宋怀恩。在宋怀恩逼宫的时刻，玉秀误会宋怀恩对她没有感情，情急之下带着孩子们从城墙上一跃而下，结束了自己的生命。玉秀到死都没有意识到宋怀恩实际上对她是有感情的，她的死对王儇和宋怀恩来说都是一种解脱。