是的，在《宝石宠物Tinkle》中，佑马和明最终在一起了。在动画的第45集中，佑马向小明表白了，并且在大结局的时候，佑马直接称呼小明为“明”，而不是平时用的“樱”。这表明他们之间的关系已经非常明确，并且得到了进一步的发展。此外，有其他粉丝创作的内容也表明他们被设定为官配，虽然主线感情线很淡甚至没有官宣。综合这些信息，可以确定佑马和明在动画中是一对。