鹿丸和飞段在《火影忍者》动画中的战斗发生在 第306集和第307集。

1. 在第306集中，鹿丸为了团队的胜利，决定将飞段引到森林的深处。尽管鹿丸利用自己的影子模仿术使飞段在自己的身边布下了大量的引爆符，但当鹿丸的影子模仿术消失之后，他立即被飞段打倒了。飞段划伤了鹿丸的脸颊，死亡的仪式再次开始。然而，飞段意外地杀死了自己的同伴角都。

2. 在第307集中，因为老师阿斯玛的身亡，鹿丸决定和飞段一对一战胜他。飞段的能力是不死之身，只要用镰刀碰到别人的血，然后诅咒，攻击自己的身体就能让对方受伤。鹿丸和卡卡西打出了完美配合，卡卡西利用雷切取得了角都的血，随后交给了鹿丸。鹿丸来到丛林和飞段战斗，最终利用苦无将飞段的头切了下来，再利用爆破符炸开了一个洞，把飞段埋了起来。虽然飞段是不死之身，但是最终会因为缺乏营养而死亡。

因此，鹿丸和飞段的战斗主要发生在第306集和第307集。