当需要在一个荣誉证书上落款三个单位时，可以采用以下方式书写：

分行排列

将三个单位的名称分别写在三行，每行一个单位，这样可以使落款显得整齐有序。例如：

```

单位一名称

单位二名称

单位三名称

```

合并排列

将三个单位的名称合并写在一行，每个单位名称之间可以用顿号（、）隔开。例如：

```

单位一名称、单位二名称、单位三名称

```

两行排列

将前两个单位名称写在一行，第三个单位名称写在下一行，两个单位名称之间可以用顿号隔开，第三个单位名称后可以加上署名和日期。例如：

```

单位一名称、单位二名称

单位三名称

```

一行排列

将三个单位名称写在一行，每个单位名称之间可以用顿号隔开，末尾加上署名和日期。例如：

```

单位一名称、单位二名称、单位三名称

```

无论采用哪种方式，都应确保落款清晰、易读，并且符合荣誉证书的正式和庄重风格。同时，建议在落款处加盖颁发单位的公章，以增加证书的权威性和正式性。