有毒的微生物种类繁多，以下是一些常见的例子：

细菌

金黄色葡萄球菌：产生肠毒素，引起食物中毒和皮肤感染。

某些种类的大肠杆菌：如O157:H7型，可引起严重肠道疾病。

沙门氏菌：通过食物、水或接触传播，引起食物中毒和肠道感染。

炭疽杆菌：通过皮肤接触、吸入或食入引起严重疾病。

肉毒杆菌：产生肉毒毒素，引起神经麻痹。

链球菌：如A群链球菌，可引起咽喉炎、扁桃体炎和肺炎。

肺炎双球菌：引起肺炎和脑膜炎。

鲍氏不动杆菌：在医院环境中引起感染，尤其是对免疫力低下的人群。

真菌

黄曲霉：产生黄曲霉毒素，是一种强致癌物质。

灰花纹鹅膏（麻母鸡）、 黄盖鹅膏（黄罗伞）、 条盖盔孢伞（假皮条菌）、 亚稀褶红菇（火炭菌）：这些野生菌含有剧毒毒素，可引起严重中毒甚至死亡。

病毒

诺如病毒：引起急性胃肠炎。

肝炎病毒：如甲型肝炎病毒和乙型肝炎病毒，引起肝脏感染。

其他微生物

支原体：如肺炎支原体，可引起肺炎。

立克次氏体：如普氏立克次体，引起恙虫病。

衣原体：如沙眼衣原体，引起沙眼和性病淋巴肉芽肿。

螺旋体：如梅毒螺旋体，引起梅毒。

这些微生物通过不同的途径进入人体，有些产生毒素，有些直接破坏组织，导致各种疾病。因此，预防感染和正确食物处理至关重要。