北京儿童医院和上海儿童医学中心都是国内知名的儿科专科医院，各有其优势。以下是它们的一些比较：

医院性质和管理

北京儿童医院：是首都医科大学附属的医院，属于上海市卫生局管理。

上海儿童医学中心：是上海交通大学医学院附属的医院，受交大和上海卫生局双重管理。

综合实力

北京儿童医院：在儿科急诊科室和重症监护室方面具有全国领先地位，尤其在儿童血液病、儿童肿瘤等领域处于国内领先地位。

上海儿童医学中心：在儿童心脏病、白血病等领域拥有完善的治疗方案和丰富的临床经验，并且特别注重科研与教学工作。

排名情况

北京儿童医院：在全国儿科医院中排名第一。

上海儿童医学中心：在全国儿科医院中排名前十。

专业特长

北京儿童医院：在儿童常见病、多发病以及疑难杂症的诊治上具有丰富的经验，尤其在儿童血液病、儿童肿瘤等领域处于国内领先地位。

上海儿童医学中心：在儿童心脏病、白血病等领域拥有完善的治疗方案和丰富的临床经验。

建议

选择哪家医院更好，主要取决于您孩子的具体病情和需求。如果孩子在血液病或肿瘤方面需要治疗，北京儿童医院可能更为合适。如果孩子在心脏病或白血病等方面需要专业治疗，上海儿童医学中心可能更为专业。此外，考虑到医院的教学和科研实力，如果您希望孩子能接受到更好的教育和科研环境，也可以考虑这两家医院。

建议您根据孩子的具体病情和医院的专业特长，选择最适合的医院进行治疗。